Цитата: avt5160701 от 17.01.2021 20:19:53Борьба с терроризмом - стандартный набор.
какой терроризм...скорее всего дошло-что за штамм вывелся в Бразилии.
https://edition.cnn.…index.html (CNN) Президент Бразилии Джаир Больсонаро сказал в пятницу, что "все средства" предоставляются для оказания помощи крупнейшему штату страны, Амазонии, где в больницах заканчиваются койки и кислородные баллоны на фоне стремительно растущего числа коронавирусных инфекций.
Его заявление прозвучало на следующий день после того, как министр здравоохранения Бразилии Эдуардо Пазуэльо охарактеризовал систему здравоохранения в столице штата Амазонас, Манаусе, как находящуюся в состоянии "краха".
"Я бы сказал да, в Манаусе происходит коллапс в здравоохранении. Очередь на получение больничной койки сильно выросла, сегодня у нас около 480 человек стоят в очереди. И реальность такова, что есть более низкое снабжение кислородом - не перебои, а более низкое снабжение кислородом", сказал он во время Facebook в прямом эфире с Bolsonaro в четверг.
В местных новостях цитируют врачей и медсестер, которые говорят, что пациенты умирают от асфиксии в городских больницах из-за недостатка кислорода.
--
В начале пятницы бразильские ВВС доставили в Манаус шесть цилиндров с жидким кислородом общим весом 9300 килограммов. Они также доставили девять пациентов и пять врачей из Манауса в город Терезина, расположенный в северо-восточном штате Пиауи.
Выступая в Бразилиа, бразильский вице-президент Гамильтон Мурао заявил, что невозможно предвидеть коллапс системы общественного здравоохранения, и обвинил в этом новый вариант коронавируса, который циркулирует в городе.
"Вы не можете предсказать, что случится с этим штаммом, который происходит в Манаусе". Полностью отличается от того, что произошло в первой половине", - сказал Муран.
В сентябре прошлого года исследования, проведенные Фондом Освальдо Круза (Fiocruz), рекомендовали блокировку после подтверждения того, что Манаус переживает вторую волну заболевания. Правительство Амазонии в то время опровергло вторую волну случаев болезни Ковида.
Манаус, известный во всем мире как ворота в регион Амазонки, также сильно пострадал во время первой волны пандемии в период с апреля по май, когда рухнула его система общественного здравоохранения и похоронная система.
человечьим языком это тут
https://www.facebook…19800/?d=n/автор-с соотв.образованием/
ЦитатаНе успели мы как следует испугаться британской разновидности коронавируса [1], как в Бразилии народилась еще одна, вероятно, не менее неприятная. Написала про нее для "Правмира" [2].
Патоген, относящийся к новой линии P.1, обнаружили при расшифровке последовательностей вирусных геномов, выделенных у пациентов в городе Манаус, столице штата Амазонас [3]. Там, как и примерно везде в Латинской Америке, ситуация с распространением вируса аховая.
Даже если меры и есть, люди их не соблюдают, потому что население этих стран бедно, а возможность зарабатывать на еду, сидя за компьютером у себя дома, есть лишь у очень маленькой части жителей.
В Манаусе все было очень плохо еще летом – в июне IgG определялись у 44% населения [3] – потом, по мере того, как порог коллективного иммунитета становился все ближе, число заражений пошло на спад, но в последние месяцы вдруг вновь стало резко нарастать. Внятных научных данных из Манауса мало, но, тем не менее, периодически ученые расшифровывают последовательности тамошних вирусов. До декабря в них не было ничего необычного: в регионе распространялись вирусы, принадлежащие к известным линиям, были видны следы многократных заносов из-за пределов Амазонаса, однако все оставалось в рамках того, что ученые наблюдают в других местах.
Но неожиданно почти в половине (42%) декабрьских образцов исследователи обнаружили неизвестную до сих пор разновидность. И одновременно с середины декабря в Манаусе пошел новый рост числа заразившихся. Связана или нет увеличившаяся скорость распространения вируса с новой разновидностью Р.1, пока неясно, но в Англии и в Дании новый рост числа выявленных случаев был вызван как раз таки новым более «приставучим» британским вариантом.
Косвенно в пользу того, что новый всплеск инфекций в Манаусе также вызвал свежепоявившийся вариант P.1, свидетельствуют мутации, которые он несет. А их в избытке.
Из значимых – 17 аминокислотных замен (то есть мутаций, которые приводят к изменению одной аминокислоты на другую в кодируемом соответствующим геном белке), 3 делеции (выпадения нескольких нуклеотидов) и 4 инсерции (вставки нескольких лишних нуклеотидов). Некоторые из этих мутаций уже встречались раньше – например, у того же британского варианта – и мы примерно представляем, как они меняют свойства вируса.
Так, ставшая уже знаменитой мутация N501Y (замена аминокислоты аспарагин на тирозин в позиции 501 последовательности спайк-белка) находится в так называемом RBD-участке, который непосредственно отвечает за присоединение спайк-белка к человеческим рецепторам ACE2. Вирусы, несущие такую замену, держатся за рецепторы прочнее. Кажется, что это должно помогать вирусу лучше проникать в клетки, но в действительности для заражения соединение с рецептором не должно быть ни слишком сильным – потому что в определенный момент ему нужно отцепиться, ни слишком слабым – так как иначе вирус будет отваливаться от клеток раньше, чем закончит необходимые для проникновения мероприятия (подробнее об этом тут [2]).
В ситуации, когда вокруг много неиммунных людей, N501Y не увеличивает шансы вируса на распространение – даже, скорее, наоборот. Но когда переболевших или вакцинированных становится больше, вирус, попав в новый организм, чаще оказывается в ситуации, когда его атакуют антитела. Самые эффективные из них бьют как раз в то место, при помощи которого вирус прикрепляется к рецепторам. Соответственно, более прочная связь становится преимуществом. Помимо британского и бразильского вариантов, N501Y независимо возникла еще у одной недавно выделившейся разновидности, так называемой южноафриканской.
Еще одна потенциально опасная для нас мутация в последовательности спайк-белка бразильского варианта называется E584K, то есть замена глутаминовой кислоты на лизин в позиции 584. У южноафриканского варианта она тоже есть, и в одной из работ было показано, что вирусы с такой заменой хуже узнаются некоторыми нейтрализующими (то есть самыми эффективными) антителами [5]. Самое важное слово в предыдущем предложении – «некоторыми». То есть не все антитела, выработанные после вакцинации или встречи с другими разновидностями коронавируса, перестают реагировать на вирусы, несущие мутацию E584K, а только те, которые были нацелены на позицию 584 и, возможно, район вокруг нее, который вследствие мутации изменился. Остальные нейтрализующие антитела – а их всегда много – продолжают работать.
Но да, E584K – явная мутацию избегания (от английского escape mutation), то есть изменение, благодаря которому вирус пытается уйти из-под иммунного ответа.
Там же в RBD-участке бразильского варианта есть изменение K417N (лизин поменялся на аргинин). По некоторым расчетным данным [6], эта мутация также может работать на повышение прочности связывания RBD с рецепторами, особенно если она идет в паре с N501Y. Если эти предположения подтвердятся, пару K417N и N501Y можно рассматривать как попытку вируса приспособиться к растущему числу людей с антителами. Как и некоторые другие мутации, она есть не только у бразильского, но и у южноафриканского варианта. Еще все три новых варианта несут делецию в последовательности ORF1b, с которой синтезируется сразу несколько коронавирусных белков, но эффект этого изменения пока неясен.
Анализ происхождения различных вариантов вируса показывает, что одинаковые мутации у всех трех новых вариантов – британского, бразильского и южноафриканского – возникли независимо (впрочем, сразу оговоримся, что для окончательной уверенности по двум последним вариантам нужно собрать больше информации, то есть как минимум расшифровать больше геномов). Такое независимое появление сходных изменений у далеких друг от друга организмов и вирусов называют конвергентной эволюцией.
Мы все знаем множество примеров этого явления – скажем, одинаковая форма тела у рыб, дельфинов ихтиозавров и даже пингвинов, крылья у птиц и летучих мышей и так далее. Сходные признаки развиваются у существ, эволюционирующих в похожих условиях – для того, чтобы лучше к этим условиям приспособиться. Например, дельфины – млекопитающие, но в какой-то момент их предки вернулись в водную среду, и форма их тела приобрела максимально подходящие для перемещения в воде очертания.
Одинаковые мутации у трех далеких друг от друга вариантов коронавирса свидетельствуют, что SARS-CoV-2 в разных частях света пытается приспособиться чему-то. К чему именно – мы пока точно не знаем, но наиболее обоснованной представляется версия, которую мы упоминали выше – о попытках избежать антительной атаки в организмах переболевших.
И в Бразилии, и в Южной Африке – по крайней мере, в некоторых регионах – их доля колеблется вокруг отметки в 40%. Другими словами, у каждого второго потенциального носителя, на которых перепрыгивает вирус, он обнаруживает антитела к себе. Они эффективно препятствуют тому, чтобы вирус заражал клетки – но если какой-то патоген случайно несет мутацию, увеличивающую прочность связывания с рецепторами, такой патоген получает преимущество и размножается успешнее остальных.
Хорошим доказательством в пользу этой версии – помимо лабораторных опытов с использованием крови переболевших – стал бы анализ доли реинфекций в регионах, где распространяются новые штаммы. Если она окажется выше, чем в местах, где этих вариантов нет, можно говорить, что описанные выше мутации действительно помогают вирусу проникать в клетки, несмотря на наличие антител.
Эпидемиологические исследования с массовой расшифровкой геномов вирусов, выделенных из заболевших, необходимы и для того, чтобы однозначно ответить на вопрос, ускоряют ли какие-то из мутаций, выявленных у новых вариантов, распространение, или же мы наблюдаем эффект основателя. Этим термином называют ситуацию, когда некий вариант начинает преимущественно размножаться в том или ином регионе не потому, что он более заразный, а из-за других причин – скажем, носитель этого варианта оказался в ситуации суперраспространения и за короткое время заразил много народу. В случае с британским вариантом данные исследований о его распространении в Англии и Дании показывают, что дело, похоже, в большей заразности, по бразильскому варианту информации пока недостаточно.
Остается открытым вопрос, что делать, если выяснится, что разновидность из Манауса действительно более заразна и хотя бы частично уходит из-под иммунного ответа. Вариант наглухо закрыть границы или изолировать города, где обнаруживается этот вариант, очевидно, не сработают. Даже в Китае, которому весной удалось удерживать в карантине сотни миллионов человек, вновь обнаруживаются десятки новых случаев, очевидно, просочившихся в страну из других стран.
Вакцинация даже в развитых странах идет крайне медленно, а имеющиеся производства даже теоретически не могут пока обеспечить вакцинами весь мир. Остается надеяться, что правительства помогут фармотрасли как можно быстрее развернуть больше новых мощностей. В противном случае вирус имеет все шансы обогнать людей и вновь обрушить системы здравоохранения.
UPD Пока писался этот текст, пришли новости, что варианты с уже знакомыми нам мутациями в RBD обнаружили в США. Похоже, вирус активно начал приспосабливаться к нарастающему иммунитету, а может, и еще к чему-то. Очевидно, эта история войдет во все будущие учебники по вирусологии, иммунологии и эпидемиологии. Может быть, это немного утешит нас. Потому что больше утешатся пока особенно нечем.