9 сентября 1801 — Баку и Бакинская область включены в состав Российской империи.

После присоединения Грузии к России в сентябре 1801 года резко возросла роль прикаспийских земель как самых удобных для доставки продовольствия и оснащения для русской армии, стоящей в Тифлисе. На основании рескрипта от 12 сентября 1801 года Александр I повелел «увеличить число приверженных к России ханов…особенно Бакинского… достигнуть до способов доставлять к войскам нашим в Грузии тягости из Астрахани водой, а не трудным путём через горы Кавказа». Срок заключения договора определялся на сентябрь 1802 года. Но ни один азербайджанский хан, в том числе бакинский, не прислали своих посланников. И лишь в конце марта 1803 года договор был подписан, но… Уже в июле 1803 года Бакинский хан под надуманным предлогом отказался от своего прошения. Вновь в духе политики и дипломатии Востока.

Между Россией и некоторыми азербайджанскими ханами (губинским, дербендским и талышским) был подписан договор о том, что эти ханы в случае нападения Ирана на Кавказ выступят против Ирана, как союзники России. По договору эти ханства переходили под покровительство России.

В 1804 году Иран потребовал у России вывода войск из Азербайджана. Россия ответила отказом, и между государствами началась война.

В 1805 году Карабахское и Шекинское ханства подписали договор о переходе под власть России.

Шамахинский хан Мустафа некоторое время, по примеру Бакинского, пытался играть в политические игры, но после поддержки русских войск шекинскими и карабахскими войсками также перешёл под российское покровительство.

В начале 1806 года кавказский наместник Павел Цицианов с отрядом около 2000 человек при 10 орудиях выдвинулся к Бакинской крепости и подошёл к ней 30 января. В письме к бакинскому хану Хусейн-Кули он потребовал сдачи города. Хан решил сдать город, но во время передачи ключей от крепости Цицианов был убит выстрелом в голову одним из приближённых хана. Отряд, лишившись командира, был вынужден отступить.
Наконец, в октябре 1806 года русские войска под управлением Сергея Алексеевича Булгакова, героя штурма Анапы в 1791 году, подошли к Баку. Бакинцы, напуганные возможной карой за коварное убийство Павла Цицианова, встретили Булгакова за несколько верст от города и вручили ему ключи от крепости.

3 октября Баку был занят, тело князя Цицианова торжественно перенесли в армянский храм города, а его убийцу Ибрагим-бека сослали в Сибирь.

Бакинское ханство было присоединено к России, а Баку стал центром вновь образованной Бакинской провинции.