Япония построила собственные казармы и летное поле в Джибути в рамках антипиратской миссии у берегов Сомали. Участие японских сил самообороны в этой миссии началось 30 марта 2009 года. Затем в конце мая 2009 года на аэродром в Джибути приземлились два японских патрульных самолета P-3-C. В авиаотряд, включая летчиков, входит около 100 человек. Для охраны техники и казарм в Джибути переброшены еще 50 военнослужащих сухопутных сил. Порт Джибути используется для стоянки кораблей Морских сил самообороны Японии. Все японские военные базируются в порту Джибути на основе ранее подписанного межправительственного соглашения