Статья:
https://www.biorxiv.…451v1.fullЦитатаTo investigate the evolution of SARS-CoV-2 in the immune population, we co-incubated authentic virus with a highly neutralizing plasma from a COVID-19 convalescent patient. The plasma fully neutralized the virus for 7 passages, but after 45 days, the deletion of F140 in the spike N-terminal domain (NTD) N3 loop led to partial breakthrough. At day 73, an E484K substitution in the receptor-binding domain (RBD) occurred, followed at day 80 by an insertion in the NTD N5 loop containing a new glycan sequon, which generated a variant completely resistant to plasma neutralization. Computational modeling predicts that the deletion and insertion in loops N3 and N5 prevent binding of neutralizing antibodies. The recent emergence in the United Kingdom and South Africa of natural variants with similar changes suggests that SARS-CoV-2 has the potential to escape an effective immune response and that vaccines and antibodies able to control emerging variants should be developed.
One Sentence Summary Three mutations allowed SARS-CoV-2 to evade the polyclonal antibody response of a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma.
...
Чтобы изучить эволюцию SARS-CoV-2 в иммунной популяции, мы совместно инкубировали аутентичный вирус с высоко нейтрализующей плазмой выздоравливающего пациента с COVID-19. Плазма полностью нейтрализовала вирус за 7 пассажей, но через 45 дней делеция F140 в петле N3 шипа N-концевого домена (NTD) привела к частичному прорыву. На 73-й день произошла замена E484K в рецептор-связывающем домене (RBD), за которой на 80-й день последовала вставка в NTD-петлю N5, содержащую новый гликановый секвон, что привело к образованию варианта, полностью устойчивого к нейтрализации плазмы. Компьютерное моделирование предсказывает, что делеция и вставка в петли N3 и N5 предотвращают связывание нейтрализующих антител. Недавнее появление в Великобритании и Южной Африке естественных вариантов с аналогичными изменениями предполагает, что SARS-CoV-2 может избежать эффективного иммунного ответа и что необходимо разработать вакцины и антитела, способные контролировать появляющиеся варианты.
Резюме одного предложения Три мутации позволили SARS-CoV-2 уклониться от ответа поликлональных антител высоко нейтрализующей плазмы выздоравливающей COVID-19.
Собственно, как я понимаю, исследователи воспроизвели процесс, происходящий в природе: вирус сталкивается с антителами и, рано или поздно, находится мутация, делающая его нечувствительным. У пациентов со сниженным иммунитетом, вирус сохраняется в организме дольше и на генерацию подходящих мутаций есть больше времени. Парадоксально, но в таком случае, терапия плазмой выздоравливающих может помочь эволюции вируса.
Аналогичный процесс происходит и у людей с нормальным иммунитетом- здесь играет роль количество. У большинства (вероятно), антитела подействуют так, как надо и нейтрализуют вирус, но, рано или поздно, найдется мутация, которая будет устойчива.
Если еще учесть имеющиеся данные о том, что у привитых вирус может какое-то время размножаться в присутствии антител* - мы получаем ровно то, что было сделано в ходе исследования: инкубацию вируса в присутствии антител. И, полагаю, с тем же результатом.
В общем, есть о чем задуматься.
----------------------------------------------------------------
*- например
https://www.biorxiv.…1.full.pdf