Охотск был объявлен военным портом. Русским правительством было принято решение о создании Охотской военной флотилии. Первым командиром Охотского порта и флотилии был назначен видный деятель петровских времен Г.Г. Скорняков-Писарев.
В Охотск стали прибывать моряки, кораблестроители. Развернулось строительство военных кораблей. Вскоре Охотскому порту пришлось сыграть выдающуюся роль в подготовке грандиозной по тем временам Второй Камчатской экспедиции. В июне 1740 г. с охотских верфей были спущены на воду построенные замечательными мастерами-кораблестроителями Макаром Рогачевым и Андреем Козьминым пакетботы «Св. Петр» и «Св. Павел». В этом же году в Охотске была открыта школа, преобразованная в 1756 г. в навигацкую школу, которая готовила штурманов для кораблей и судов, плававших на Дальнем Востоке. На подходах к Охотскому порту выставляется первое штатное навигационное ограждение фарватера, организуется лоцманская служба, сооружается маяк. К середине XVIII столетия Охотская флотилия насчитывала семь кораблей (три бота, три галиота и одна бригантина).
