7 марта 2017 года президент России помиловал Оксану Севастиди, осужденную по аналогичному делу. Оксана Севастиди была арестована в 2015 году. В 2016 году суд признал ее виновной в госизмене и приговорил к семи годам
лишения свободы. После выхода Оксаны Севастиди на свободу ее адвокаты пытались добиться отмены приговора, однако Верховный суд признал его законным.
Путин помиловал Марину Джанджгаву и Анник Кесян14 июня 2016 года президент России Владимир Путин подписал указы о помиловании осужденных в России украинцев Геннадия Афанасьева и Юрия Солошенко. Афанасьева задержали в Симферополе по делу "крымских террористов" в мае 2014 года, 17 декабря 2014 года его приговорили к семи годам колонии строгого режима. Дело 73-летнего Солошенко маркировано грифом "секретно". По данным СМИ, он собирался вывезти на Украину части некоего российского вооружения. Солошенко задержали в Москве при встрече с "деловым партнером" из Минобороны России. Мосгорсуд 14 октября 2015 года приговорил его к шести годам
колонии строгого режима.
25 мая 2016 года президент РФ подписал указ о помиловании осужденной в России украинской военнослужащей Надежды Савченко. 22 марта 2016 года Савченко была осуждена на 22 года колонии по делу об убийстве журналистов ВГТРК в Донбассе. Суд установил, что 17 июня 2014 года она скорректировала артиллерийский огонь по группе луганских ополченцев и российских журналистов, в результате которого погибли сотрудники ВГТРК
Игорь Корнелюк и Антон Волошин.
20 декабря 2013 года Путин помиловал экс-главу компании ЮКОС Михаила Ходорковского. Хамовнический суд Москвы в конце 2010 года приговорил экс-главу МФО "Менатеп" Платона Лебедева и
Михаила Ходорковского к 14 годам колонии каждого по обвинению в хищении 200 миллионов тонн нефти и "отмывании" денег с учетом наказания, назначенного Мещанским судом Москвы в мае 2005 года по первому делу (девять лет
лишения свободы, в сентябре 2005 года срок был снижен до
восьми лет). Затем приговор был смягчен на год. Президиум Мосгорсуда 20 декабря 2012 года снизил им
срок заключения с 13 до 11 лет.
14 мая 2012 года президент России подписал указ о помиловании матери двух детей Анастасии Дорониной, осужденной на четыре года за ДТП в городе Гусь-Хрустальный (Владимирская область), где погибли два подростка. Дело Дорониной вызвало широкий общественный резонанс. Летом 2008 года ее машина столкнулась с мотоциклом, авария стала причиной смерти двух подростков — водителя и пассажира мотоцикла. Гусь-Хрустальный городской суд в 2010 году признал ее виновной в совершении преступления, предусмотренного частью 3 статьи 264 УК РФ (нарушение правил дорожного движения, повлекшее по неосторожности смерть). Дорониной было назначено наказание в виде четырех лет колонии-поселения, она также должна выплатить 2,4 миллиона рублей в пользу потерпевших. На момент
помилования женщина выплатила 2,2 миллиона рублей.
23 апреля 2012 года стало известно, что президент РФ Дмитрий Медведев подписал указ о помиловании Сергея Мохнаткина, осужденного за нападение на милиционера 31 декабря 2009 года на несанкционированном митинге на
Триумфальной площади в Москве. Правозащитники утверждали, что Мохнаткин не участвовал в акции, а вступился за одну из
митинговавших, которую задерживал милиционер.
5 августа 2011 года президент России Дмитрий Медведев подписал указ о помиловании
актрисы Натальи Захаровой. Она была осуждена французским судом в 2006 году по обвинению в попытке поджога квартиры ее бывшего мужа и несколько лет не возвращалась во Францию, опасаясь ареста. В конце 2010 года она приехала в Париж, чтобы бороться в суде за свои родительские права и возможность видеться с дочерью, которую она не видела около пяти лет. В суде ее задержали и вскоре доставили в женскую тюрьму под Парижем. В конце мая 2011 года актриса была доставлена в Россию для отбывания наказания по приговору французского суда. Она подала прошение о помиловании, и 5 августа президент РФ подписал соответствующий указ. 9 августа она вышла из
колонии в Костроме.
9 июля 2010 года президент РФ Дмитрий Медведев подписал указ о помиловании гражданина России Игоря Сутягина, осужденного за
шпионаж. Заведующий сектором военно-технической и военно-экономической политики отдела внешнеполитических исследований Института США и Канады РАН Игорь Сутягин обвинялся в передаче сведений, составляющих государственную тайну, представителям британской консалтинговой фирмы "Альтернатив-Фьючерс". Эта фирма, по данным ФСБ России, являлась "крышей" для разведки США и не имела никакого отношения к научной деятельности. Сутягин 7 апреля 2004 года был признан виновным в госизмене в форме шпионажа и приговорен к 15 годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии строгого режима. Ученого вместе с тремя другими помилованными, ранее осужденными в разное время в России за шпионаж — Геннадием Василенко, Сергеем Скрипалем и Александром Запорожским — обменяли на 10 человек, задержанных в конце июня 2010 года в США по обвинению в нелегальной деятельности в пользу РФ. Обмен состоялся в Вене. 26 сентября 2012 года президиум Верховного суда РФ оставил без изменения приговор российскому ученому
Игорю Сутягину, осужденному на 15 лет за шпионаж.