DeC ( Профессионал ) | |
04 янв 2021 13:34:24 |
DeC ( Профессионал ) | |
04 янв 2021 13:36:15 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:34:24
Ajarius ( Практикант ) | |
04 янв 2021 13:46:36 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
ex3mer ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 14:40:40 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
est2004_1 ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 15:06:47 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
завхоз ( Практикант ) | |
04 янв 2021 16:07:07 |
Цитата: est2004_1 от 04.01.2021 15:06:47
Jameson ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 15:30:33 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
Alex_new ( Специалист ) | |
04 янв 2021 16:24:51 |
Цитата: Jameson от 04.01.2021 15:30:33
Andrew Carlssin ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 15:36:54 |
Alex2011 ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 15:54:49 |
brigadir v.2.0. ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:31:28 |
Цитата: Alex2011 от 04.01.2021 15:54:49
dmitriк62 ( Практикант ) | |
04 янв 2021 16:54:37 |
bvlad ( Специалист ) | |
04 янв 2021 17:26:48 |
Цитата: dmitriк62 от 04.01.2021 16:54:37
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 17:51:22 |
Цитата: bvlad от 04.01.2021 17:26:48
bvlad ( Специалист ) | |
04 янв 2021 17:57:46 |
Цитата: becool от 04.01.2021 17:51:22
Danilov71 ( Практикант ) | |
04 янв 2021 18:03:58 |
Цитата: becool от 04.01.2021 17:51:22
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:20:49 |
Цитата: Danilov71 от 04.01.2021 18:03:58
dmitriк62 ( Практикант ) | |
04 янв 2021 18:47:51 |
Цитата: becool от 04.01.2021 18:20:49
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:56:56 |
Цитата: dmitriк62 от 04.01.2021 18:47:51
Старый кэп I ( Профессионал ) | |
04 янв 2021 18:26:07 |
Цитата: becool от 04.01.2021 17:51:22
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:43:50 |
Alex_new ( Специалист ) | |
04 янв 2021 18:56:36 |
Rava ( Специалист ) | |
04 янв 2021 19:00:03 |
Цитата: becool от 04.01.2021 18:49:30
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 19:04:35 |
Цитата: Rava от 04.01.2021 19:00:03
bb1788 ( Практикант ) | |
04 янв 2021 19:05:05 |
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 19:06:11 |
Цитата: bb1788 от 04.01.2021 19:05:05
NavyGator ( Профессионал ) | |
05 янв 2021 03:24:53 |
ЦитатаМы столкнулись со всемирной инвазией нового коронавируса. Она последовала за несколькими ограниченными вспышками похожих вирусов в различных местах в недавнем прошлом (ОРВИ, MERS). Хотя основной текущей целью исследователей во всём мире является обеспечение эффективных терапевтических и профилактических решений для населения планеты , нам также обязательно нужно лучше понять происхождение новой эпидемии, вызванной коронавирусом, чтобы избежать будущих вспышек. Данное молекулярное исследование ставило своей целью изучение с помощью биоинформационного подхода фактов, касающихся вируса и его предшественников.
В этой статье показано, что 16 фрагментов (гены Env Pol и Integrase) различных штаммов, в том числе, диверсифицированных ретровирусов HIV1, HIV2 и SIV имеют высокий процент гомологии в части генома COVID_19. Кроме того, каждый из этих элементов состоит из 18 или более нуклеотидов и поэтому можетбытьй связан с функцией . Они называются экзогенными информативными элементами (ЭИЭ).
Среди этих ЭИЭ 12 сосредоточены в очень небольшой области генома COVID-19, длиной менее 900 пар оснований, то есть менее 3% от общей длины этого генома. Кроме того, эти ЭИЭ позиционируются в двух функциональных генах COVID-19: генах orf1ab и S-шипа.
Представляем два основных факта, которые способствуют нашей гипотезе о том, что геном КОВИД-19 был частично синтезирован: смежная область, представляющая 2,49% всего COVID-19 генома, 40,99% которого состоит из 12 различных фрагментов, происходящих из различных штаммов ретровирусов SIV ВИЧ (вируса иммунодефицита обезьян. Некоторые из этих 12 ЭИЭ выглядят конкатенированными. Примечательно, что ретровирусная часть этих областей, которая состоит из 8 элементов из различных штаммов ВИЧ-1, ВИЧ-2 и ВИО (SIV, обезьяний ретровирус), охватывает длину 275 смежных оснований COVID-19. Совокупная длина этих 8 элементов ВИЧ/SIV составляет 200 пар оснований. Следовательно, плотность ВИЧ SIV в этой области COVID-19 составляет 200/275 = 72,73%.
Большая часть из этих 16 ЭИЭ уже существовала в первых геномах атипичной пневмонии еще в 2003 году. Однако мы продемонстрировали, как новый регион включая 4 HIV1 HIV2 Внешние Информативные Элементы радикально отличают все штаммы COVID-19 от всех SARS вирусов и коронавирусов летучих мышей, за исключением вируса летучих мышей RaTG13.
Мы собрали факты о возможных истоках COVID_19. Мы, в частности, проанализировали эту небольшую область из 225 оснований, общих для COVID_19 и летучих мышей RaTG13.
Мы изучили самую последнюю генетическую эволюцию COVID_19 штаммов, вовлеченных в мировую эпидемию. Мы обнаружили значительное возникновение мутаций и делеций в области 225 оснований.
На выборке геномов мы показали, что этот участок из 225 основных ключевых областей каждого генома, богатых ЭИЭ и 1770 пар оснований области, кодирующей шиповидный S-белок развивались гораздо быстрее, чем весь геном (выборка геномов 44 пациентов из Сиэтла в штате Вашингтон, оригинального эпицентра в США).
В сравнительном анализе обоих генов SPIKES COVID_19 и Bat RaTG13 мы отметили два аномальных факта:
1) вставка 4 смежных аминокислот PRRA в середине SPIKE (мы показали, что этот сайт уже был оптимальным сайтом расщепления до этой вставки).
2) аномальное распределение синонимичных кодонов во второй половине SPIKE.
Наконец, мы показали вставку в эту область 1770 оснований SPIKE значительной пары ЭИЭ из Plasmodium Yoelii и апозитивной ВИЧ-1 ЭИЭ с критической мутацией Spike.
ЦитатаПочему COVID-19 мог появиться благодаря лабораторным манипуляциям?
Следующие 4 доказательства касаются различий относительно SARS, или характерного для COVID-19 и летучей мыши RaTG13 или фактов, радикально дифференцирующих эти 2 последовательности, которые, как утверждается, возникли в результате естественной эволюции первого (COVID-19) из второго (вирус летучей мыши RaTG13).
Мы оценили эти 4 доказательства в возрастающем порядке важности согласно нашей точке зрения.
1) Четыре ЭИЭ официально отличают геномы COVID-19 и вируса летучей мыши RaTG13 от всех других SARS или геномов вирусов летучих мышей. Однако их уровень гомологий ВИЧ/SIV, по-видимому, гораздо более очевиден для COVID-19, чем для RaTG13 летучих мышей, как если бы эти фрагменты ЭИЭ были недавно "повторно введены" в геном COVID-19. = = > см. & 7, (рисунки 4 и 5).
2) естественные делеции (США Сиэтл, штат Вашингтон) применяются в приоритете к вставкам ЭИЭ(ВИЧ Кения и т.д.). = = > см. полную часть III и рис. 12 в § 13.
3) Мутации синонимичных кодонов в области 1770 оснований SPIKE, которые имитируют естественную эволюцию RaTG13 летучих мышей в сторону COVID-19 при сохранении оптимальности, полученной в аминокислотных значениях, вероятно, из "усиления функции" лабораторных экспериментов (оптимальность, общая для обеих последовательностей РНК COVID-19 и bat RaTG13) = = > см. фиг.10 в & 11 и фиг.11 в § 12.
4) аминокислоты "PRRA" были вставлены точно в положение SPIKE, уже теоретически оптимальное как для COVID-19, так и для RATG13 (из которых оно составляет основное отличие). = = > см. рис. 13 в & 14
ЦитатаЛюк Антуа́н Монтанье́ (фр. Luc Antoine Montagnier; 18 августа 1932, Шабри, Франция) — французский вирусолог, кавалер ордена Почётного легиона, лауреат Нобелевской премии в области медицины и физиологии 2008 года, которую он разделил с Харальдом цур Хаузеном и Франсуазой Барре-Синусси. Вместе с Барре-Синусси открыл в 1983 году ретровирус ВИЧ, вызывающий у человека ВИЧ-инфекцию.
Член Французской академии наук (1996; корреспондент с 1990).
ILPetr ( Практикант ) | |
04 янв 2021 17:06:31 |
АрктикЪ ( Специалист ) | |
04 янв 2021 15:53:42 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
Vick ( Практикант ) | |
04 янв 2021 17:27:53 |
Цитата: АрктикЪ от 04.01.2021 15:53:42
schaman1 ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 16:14:14 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
ILPetr ( Практикант ) | |
04 янв 2021 16:48:23 |
Цитата: DeC от 04.01.2021 13:36:15
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:01:20 |
Цитата: ILPetr от 04.01.2021 16:48:23
ДедМиши ( Специалист ) | |
04 янв 2021 18:05:59 |
Цитата: becool от 04.01.2021 18:01:20
becool ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:23:58 |
Цитата: ДедМиши от 04.01.2021 18:05:59
ДедМиши ( Специалист ) | |
04 янв 2021 18:31:50 |
Цитата: becool от 04.01.2021 18:23:58
Ox41475011 ( Слушатель ) | |
04 янв 2021 18:02:45 |
Цитата: ILPetr от 04.01.2021 16:48:23